Направить все url на один обработчик
httpd.conf
<Directory /var/www/html>
AllowOverride All
</Directory>
.htaccess
Options +FollowSymLinks # для работы mod_rewrite
RewriteEngine On
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f # если файл по ссылке не существует
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d # или папка
RewriteRule .* index.pl [L]
Заставить httpd исполнять perl:
yum install perl-libwww-perl perl-MailTools perl-MIME-Lite perl-CGI perl-DBI 'perl(HTML::Template)' mod_perl
httpd.conf
DirectoryIndex .. index.pl
AddHandler cgi-script .cgi .pl
<Directory /var/www/html>
Options ExecCGI
</Directory>
Обширный пост на хабре